Protection contre les bio-agresseurs
Caractérisation de la microflore des systèmes aquaponiques
Les systèmes aquaponiques, au croisement de l’aquaculture et de l’hydroponie, constituent une solution innovante et durable pour la production alimentaire en milieu urbain. En s’appuyant sur des cycles biologiques fermés et sur la limitation des intrants chimiques, ils offrent un cadre particulièrement pertinent pour le développement de stratégies de protection des cultures fondées sur les équilibres microbiens.
Cette recherche vise à caractériser la microflore associée aux systèmes aquaponiques (eau, biofiltres, rhizosphère et surfaces racinaires) et à évaluer son rôle dans la régulation des bio-agresseurs, notamment les pathogènes telluriques et hydriques affectant les cultures végétales. L’hypothèse centrale repose sur le fait que la diversité et la structuration des communautés microbiennes constituent un levier majeur de protection biologique, par des mécanismes tels que la compétition, l’antibiose, la colonisation des racines et l’induction des défenses des plantes.
Les travaux s’appuient sur :
- l’analyse qualitative et quantitative des communautés microbiennes présentes dans différents compartiments du système aquaponique ;
- l’identification de microorganismes bénéfiques capables de limiter le développement de pathogènes (oomycètes, champignons et bactéries phytopathogènes) ;
- l’étude des interactions entre microflore, plantes cultivées et paramètres du système (qualité de l’eau, charge organique, pratiques de gestion).
Les résultats visent à mieux comprendre le fonctionnement microbiologique des systèmes aquaponiques et à poser les bases de stratégies de biocontrôle intégrées, adaptées aux contraintes de l’agriculture urbaine. À terme, cette recherche contribue au développement de systèmes de production plus résilients, réduisant le recours aux produits phytosanitaires et renforçant la durabilité sanitaire, environnementale et économique de l’aquaponie.
